Le projet ArchaeoDyn poursuit l’expérience de recherche collective amorcée par les programmes européens Archaeomedes I (1992-1994) et II (1996-1999). Le projet a pour objectif d’approfondir l’analyse des interactions spatiales entre des groupes sociaux, les ressources qu’ils exploitent  et les itinéraires qui régissent les flux à différentes périodes et à courte, moyenne et longue distance.
Ce programme, piloté par la MSHE Ledoux à Besançon, compte huit partenaires regroupant des archéologues, des géomaticiens et des géographes.
L’enquête progresse en explorant plusieurs thèmes, abordés à des échelles géographiques variées, de la microrégion à l’Europe occidentale et centrale, en passant par l’espace territorial français, du Néolithique à l’époque Moderne. Cette enquête archéologique porte sur différents types d’objets : des objets manufacturés en pierre ou en métal, des systèmes d’habitat, des aires cultivées durant les périodes considérées, des parcellaires antiques ou médiévaux fossilisés par la forêt, etc.
L’objectif est de modéliser l’évolution des espaces qui livrent ces activités d’occupation et d’activité et de caractériser, leur taux d’anthropisation et l’évolution de cette anthropisation : modalités de la conquête agraire de l’espace, croissance et décroissance, voire abandon de l’occupation, de telle ou telle activité, de la consommation de tel type d’objets.
A cette fin, l’objectif est de mettre au point des indicateurs quantitatifs et qualitatifs permettant de mesurer et de comparer, par phase chronologique, la dynamique des territoires, leur attractivité, leurs compétences, leur rapport avec la hiérarchie sociale comme facteur de stimulation et de développement économique.